Kanata Age adalah seorang pemuda yang tinggal di akademi yang mengambang dilangit yakni akademi “Mystogan”. Dulunya dia tergabung dalam tim tingkat S yakni S128. Karena suatu insiden, ia akhirnya dicap sebagai pengkhianat, dan ditugaskan sebagai pengajar bagi tim yang penuh dengan murid yang bermasalah dalam sisi akademis, merekalah Fireteam E601. Apakah Kanata Age bisa mengembalikan namanya yang tercemar dan dicap sebagai pengkhianat? Dan apakah ia mampu memenuhi tugasnya sebagai pengajKuusen Madoushi Kouhosei no Kyoukanar bagi Fireteam E601?